Kitabesi günümüze ulaşmayan çeşmenin arşiv kayıtları, yapının ilk olarak 15. yüzyılda inşa edildiğini, 17. yüzyılda Vakıf Su Defteri’nde kayıt altına alındığını ve 19. yüzyılda yeniden onarıldığını ortaya koyuyor. Çeşmenin tarih boyunca Kabakulak Mehmed Mustafa Ağa, Kabakulak Ahmed Çavuş ve Hacı Murad Ağa tarafından yaşatıldığı biliniyor.
Restorasyon kapsamında çeşme yüzeylerinde zaman içerisinde yapılan çimento esaslı ve özgün dokuya zarar veren müdahaleler titizlikle temizlendi. Çeşme önünde gerçekleştirilen arkeolojik kazılarda özgün ayna taşına ait parçalar gün yüzüne çıkarıldı. Birleştirilmesi mümkün olmayan bu parçalar ile aynı döneme ait çeşmeler referans alınarak, özgün formuna uygun yeni ayna taşı üretildi.
Çalışmalar sırasında sonradan eklenen imalatların kaldırılmasıyla özgün hazne duvarları ortaya çıkarılırken, cephede eksik kalan örgü dokusu mevcut tarihî izler esas alınarak tamamlandı. Bitki oluşumlarından arındırılan yapının kurnası da özgün karakterine uygun şekilde yeniden üretildi.
Restorasyonun son aşamasında su tesisatı tamamen yenilenen Kabakulak Çeşmesi, yeniden akmaya başlayan suyuyla tarihî kimliğini ve kamusal işlevini yeniden kazandı. Böylece Fatih’in kültürel mirasına ait önemli su yapılarından biri daha gelecek nesillere aktarılmak üzere koruma altına alınmış oldu.
